Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRJQ12913 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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PTPRJQ12913 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRJQ12913 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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