Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSME1Q06323 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms