Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD164Q04900 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD164Q04900 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD164Q04900 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms