Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms