Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms