Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcdP82347 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcdP82347 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcdP82347 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcdP82347 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcdP82347 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcdP82347 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgcdP82347 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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