Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms