Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSNK2A1P68400 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CSNK2A1P68400 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms