Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
VBP1P61758 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
VBP1P61758 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
VBP1P61758 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
VBP1P61758 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
VBP1P61758 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VBP1P61758 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VBP1P61758 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VBP1P61758 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VBP1P61758 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VBP1P61758 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VBP1P61758 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VBP1P61758 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VBP1P61758 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VBP1P61758 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VBP1P61758 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VBP1P61758 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VBP1P61758 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VBP1P61758 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VBP1P61758 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VBP1P61758 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VBP1P61758 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VBP1P61758 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VBP1P61758 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VBP1P61758 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VBP1P61758 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VBP1P61758 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VBP1P61758 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VBP1P61758 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VBP1P61758 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VBP1P61758 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VBP1P61758 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VBP1P61758 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VBP1P61758 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VBP1P61758 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VBP1P61758 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VBP1P61758 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VBP1P61758 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VBP1P61758 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VBP1P61758 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VBP1P61758 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VBP1P61758 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VBP1P61758 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VBP1P61758 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VBP1P61758 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VBP1P61758 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VBP1P61758 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VBP1P61758 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VBP1P61758 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VBP1P61758 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VBP1P61758 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VBP1P61758 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VBP1P61758 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VBP1P61758 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VBP1P61758 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms