Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX2-5P52952 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms