Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms