Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRATP43155 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRATP43155 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRATP43155 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRATP43155 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRATP43155 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRATP43155 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRATP43155 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRATP43155 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRATP43155 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CRATP43155 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRATP43155 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRATP43155 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRATP43155 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRATP43155 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRATP43155 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRATP43155 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRATP43155 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRATP43155 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CRATP43155 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRATP43155 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRATP43155 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRATP43155 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRATP43155 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRATP43155 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRATP43155 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRATP43155 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRATP43155 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRATP43155 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRATP43155 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRATP43155 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRATP43155 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRATP43155 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRATP43155 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRATP43155 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRATP43155 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRATP43155 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRATP43155 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRATP43155 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRATP43155 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRATP43155 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRATP43155 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRATP43155 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRATP43155 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRATP43155 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRATP43155 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRATP43155 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRATP43155 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRATP43155 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRATP43155 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CRATP43155 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRATP43155 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRATP43155 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRATP43155 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRATP43155 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRATP43155 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRATP43155 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRATP43155 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRATP43155 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRATP43155 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRATP43155 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRATP43155 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms