Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
NCAPD3P42695 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
NCAPD3P42695 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NCAPD3P42695 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NCAPD3P42695 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
NCAPD3P42695 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
NCAPD3P42695 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
NCAPD3P42695 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NCAPD3P42695 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
NCAPD3P42695 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NCAPD3P42695 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NCAPD3P42695 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC33.82■■■■□ 3
NCAPD3P42695 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC33.82■■■■□ 3
NCAPD3P42695 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
NCAPD3P42695 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC33.82■■■■□ 3
NCAPD3P42695 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC33.82■■■■□ 3
NCAPD3P42695 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC33.82■■■■□ 3
NCAPD3P42695 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NCAPD3P42695 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
NCAPD3P42695 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NCAPD3P42695 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
NCAPD3P42695 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
NCAPD3P42695 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC33.81■■■■□ 3
NCAPD3P42695 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
NCAPD3P42695 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NCAPD3P42695 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
NCAPD3P42695 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
NCAPD3P42695 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NCAPD3P42695 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NCAPD3P42695 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NCAPD3P42695 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NCAPD3P42695 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
NCAPD3P42695 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC33.8■■■■□ 3
NCAPD3P42695 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
NCAPD3P42695 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NCAPD3P42695 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NCAPD3P42695 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NCAPD3P42695 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NCAPD3P42695 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NCAPD3P42695 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NCAPD3P42695 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NCAPD3P42695 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NCAPD3P42695 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NCAPD3P42695 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC33.79■■■■□ 3
NCAPD3P42695 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NCAPD3P42695 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NCAPD3P42695 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NCAPD3P42695 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NCAPD3P42695 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NCAPD3P42695 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
NCAPD3P42695 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NCAPD3P42695 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NCAPD3P42695 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NCAPD3P42695 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NCAPD3P42695 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC33.78■■■■□ 3
NCAPD3P42695 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NCAPD3P42695 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NCAPD3P42695 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
NCAPD3P42695 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
NCAPD3P42695 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
NCAPD3P42695 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC33.78■■■■□ 3
NCAPD3P42695 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NCAPD3P42695 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NCAPD3P42695 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NCAPD3P42695 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms