Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KDM5CP41229 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KDM5CP41229 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KDM5CP41229 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5CP41229 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5CP41229 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5CP41229 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5CP41229 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5CP41229 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5CP41229 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5CP41229 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5CP41229 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5CP41229 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5CP41229 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5CP41229 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5CP41229 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5CP41229 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KDM5CP41229 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5CP41229 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms