Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PEX2P28328 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PEX2P28328 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PEX2P28328 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PEX2P28328 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PEX2P28328 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PEX2P28328 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PEX2P28328 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PEX2P28328 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PEX2P28328 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PEX2P28328 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PEX2P28328 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PEX2P28328 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PEX2P28328 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PEX2P28328 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PEX2P28328 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PEX2P28328 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PEX2P28328 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PEX2P28328 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PEX2P28328 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PEX2P28328 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PEX2P28328 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PEX2P28328 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PEX2P28328 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PEX2P28328 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PEX2P28328 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PEX2P28328 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PEX2P28328 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX2P28328 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX2P28328 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX2P28328 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX2P28328 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX2P28328 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX2P28328 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX2P28328 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX2P28328 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX2P28328 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX2P28328 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX2P28328 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX2P28328 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX2P28328 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX2P28328 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX2P28328 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX2P28328 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX2P28328 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX2P28328 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX2P28328 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX2P28328 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX2P28328 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX2P28328 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX2P28328 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX2P28328 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX2P28328 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX2P28328 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX2P28328 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX2P28328 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX2P28328 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX2P28328 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX2P28328 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX2P28328 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX2P28328 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX2P28328 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX2P28328 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX2P28328 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX2P28328 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX2P28328 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX2P28328 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX2P28328 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX2P28328 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX2P28328 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX2P28328 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX2P28328 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX2P28328 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX2P28328 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX2P28328 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX2P28328 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX2P28328 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX2P28328 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX2P28328 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX2P28328 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX2P28328 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX2P28328 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX2P28328 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX2P28328 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX2P28328 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX2P28328 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX2P28328 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX2P28328 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX2P28328 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX2P28328 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX2P28328 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX2P28328 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX2P28328 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX2P28328 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX2P28328 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX2P28328 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX2P28328 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX2P28328 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX2P28328 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX2P28328 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms