Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms