Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
S100A1P23297 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
S100A1P23297 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
S100A1P23297 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
S100A1P23297 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
S100A1P23297 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
S100A1P23297 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
S100A1P23297 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
S100A1P23297 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
S100A1P23297 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
S100A1P23297 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
S100A1P23297 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
S100A1P23297 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
S100A1P23297 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
S100A1P23297 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
S100A1P23297 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
S100A1P23297 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
S100A1P23297 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
S100A1P23297 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
S100A1P23297 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
S100A1P23297 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
S100A1P23297 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
S100A1P23297 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
S100A1P23297 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
S100A1P23297 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
S100A1P23297 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
S100A1P23297 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
S100A1P23297 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
S100A1P23297 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
S100A1P23297 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
S100A1P23297 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
S100A1P23297 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
S100A1P23297 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
S100A1P23297 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
S100A1P23297 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
S100A1P23297 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
S100A1P23297 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms