Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD33P20138 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD33P20138 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD33P20138 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD33P20138 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD33P20138 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD33P20138 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD33P20138 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD33P20138 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD33P20138 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD33P20138 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD33P20138 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD33P20138 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD33P20138 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD33P20138 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD33P20138 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD33P20138 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD33P20138 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD33P20138 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD33P20138 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD33P20138 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD33P20138 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD33P20138 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms