Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPI1P17947 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPI1P17947 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPI1P17947 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPI1P17947 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPI1P17947 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPI1P17947 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPI1P17947 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPI1P17947 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPI1P17947 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPI1P17947 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SPI1P17947 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPI1P17947 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPI1P17947 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPI1P17947 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPI1P17947 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms