Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XBP1P17861 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XBP1P17861 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XBP1P17861 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XBP1P17861 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XBP1P17861 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XBP1P17861 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XBP1P17861 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XBP1P17861 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XBP1P17861 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XBP1P17861 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XBP1P17861 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XBP1P17861 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XBP1P17861 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XBP1P17861 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XBP1P17861 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XBP1P17861 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XBP1P17861 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XBP1P17861 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XBP1P17861 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XBP1P17861 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XBP1P17861 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XBP1P17861 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XBP1P17861 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XBP1P17861 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XBP1P17861 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XBP1P17861 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XBP1P17861 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XBP1P17861 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XBP1P17861 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XBP1P17861 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XBP1P17861 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XBP1P17861 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
XBP1P17861 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XBP1P17861 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XBP1P17861 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XBP1P17861 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
XBP1P17861 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XBP1P17861 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
XBP1P17861 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
XBP1P17861 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
XBP1P17861 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XBP1P17861 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XBP1P17861 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XBP1P17861 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XBP1P17861 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XBP1P17861 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XBP1P17861 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XBP1P17861 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
XBP1P17861 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XBP1P17861 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XBP1P17861 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XBP1P17861 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XBP1P17861 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XBP1P17861 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XBP1P17861 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XBP1P17861 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XBP1P17861 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XBP1P17861 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XBP1P17861 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XBP1P17861 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XBP1P17861 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XBP1P17861 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XBP1P17861 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XBP1P17861 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XBP1P17861 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XBP1P17861 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XBP1P17861 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XBP1P17861 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XBP1P17861 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XBP1P17861 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XBP1P17861 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XBP1P17861 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XBP1P17861 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XBP1P17861 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XBP1P17861 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XBP1P17861 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XBP1P17861 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XBP1P17861 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
XBP1P17861 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XBP1P17861 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XBP1P17861 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XBP1P17861 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XBP1P17861 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XBP1P17861 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XBP1P17861 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XBP1P17861 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XBP1P17861 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
XBP1P17861 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XBP1P17861 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XBP1P17861 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XBP1P17861 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XBP1P17861 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XBP1P17861 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XBP1P17861 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XBP1P17861 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XBP1P17861 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XBP1P17861 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XBP1P17861 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XBP1P17861 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms