Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RLBP1P12271 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms