Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI4P10075 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI4P10075 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GLI4P10075 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GLI4P10075 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GLI4P10075 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GLI4P10075 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI4P10075 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI4P10075 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI4P10075 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GLI4P10075 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms