Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB1P08034 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB1P08034 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB1P08034 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB1P08034 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB1P08034 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB1P08034 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB1P08034 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB1P08034 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB1P08034 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB1P08034 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB1P08034 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB1P08034 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB1P08034 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB1P08034 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB1P08034 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB1P08034 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB1P08034 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB1P08034 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB1P08034 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB1P08034 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB1P08034 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB1P08034 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB1P08034 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB1P08034 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB1P08034 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB1P08034 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB1P08034 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB1P08034 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB1P08034 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB1P08034 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB1P08034 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB1P08034 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB1P08034 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB1P08034 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB1P08034 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB1P08034 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB1P08034 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB1P08034 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB1P08034 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB1P08034 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB1P08034 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB1P08034 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB1P08034 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB1P08034 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB1P08034 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB1P08034 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB1P08034 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB1P08034 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB1P08034 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB1P08034 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB1P08034 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB1P08034 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB1P08034 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB1P08034 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB1P08034 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB1P08034 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB1P08034 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB1P08034 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB1P08034 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB1P08034 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB1P08034 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB1P08034 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB1P08034 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB1P08034 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB1P08034 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB1P08034 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB1P08034 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB1P08034 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB1P08034 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB1P08034 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB1P08034 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB1P08034 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB1P08034 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB1P08034 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB1P08034 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB1P08034 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB1P08034 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJB1P08034 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJB1P08034 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJB1P08034 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJB1P08034 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJB1P08034 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB1P08034 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB1P08034 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB1P08034 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB1P08034 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB1P08034 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB1P08034 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB1P08034 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB1P08034 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB1P08034 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB1P08034 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB1P08034 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB1P08034 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB1P08034 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB1P08034 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB1P08034 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB1P08034 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB1P08034 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms