Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
POLR1AO95602 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms