Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUBNO60494 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUBNO60494 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUBNO60494 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUBNO60494 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUBNO60494 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUBNO60494 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUBNO60494 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUBNO60494 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUBNO60494 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUBNO60494 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUBNO60494 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CUBNO60494 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUBNO60494 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUBNO60494 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUBNO60494 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUBNO60494 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUBNO60494 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUBNO60494 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUBNO60494 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CUBNO60494 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUBNO60494 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUBNO60494 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CUBNO60494 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUBNO60494 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUBNO60494 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUBNO60494 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CUBNO60494 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms