Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP10AO60312 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms