Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOX15O60248 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SOX15O60248 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOX15O60248 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SOX15O60248 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOX15O60248 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOX15O60248 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOX15O60248 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOX15O60248 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOX15O60248 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOX15O60248 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOX15O60248 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOX15O60248 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOX15O60248 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX15O60248 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX15O60248 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms