Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTRA2O43464 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HTRA2O43464 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms