Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms