Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms