Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF646O15015 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms