Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms