Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERVV-1B6SEH8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVV-1B6SEH8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms