Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEURL1BA8MQ27 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NEURL1BA8MQ27 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms