Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubl3Q9Z2M6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubl3Q9Z2M6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubl3Q9Z2M6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubl3Q9Z2M6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ubl3Q9Z2M6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ubl3Q9Z2M6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubl3Q9Z2M6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubl3Q9Z2M6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubl3Q9Z2M6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubl3Q9Z2M6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubl3Q9Z2M6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubl3Q9Z2M6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubl3Q9Z2M6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubl3Q9Z2M6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubl3Q9Z2M6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubl3Q9Z2M6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubl3Q9Z2M6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubl3Q9Z2M6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubl3Q9Z2M6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubl3Q9Z2M6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubl3Q9Z2M6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubl3Q9Z2M6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubl3Q9Z2M6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubl3Q9Z2M6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubl3Q9Z2M6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubl3Q9Z2M6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubl3Q9Z2M6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubl3Q9Z2M6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubl3Q9Z2M6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubl3Q9Z2M6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubl3Q9Z2M6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubl3Q9Z2M6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubl3Q9Z2M6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubl3Q9Z2M6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubl3Q9Z2M6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubl3Q9Z2M6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubl3Q9Z2M6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubl3Q9Z2M6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubl3Q9Z2M6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubl3Q9Z2M6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubl3Q9Z2M6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubl3Q9Z2M6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubl3Q9Z2M6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubl3Q9Z2M6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubl3Q9Z2M6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubl3Q9Z2M6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubl3Q9Z2M6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubl3Q9Z2M6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubl3Q9Z2M6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubl3Q9Z2M6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubl3Q9Z2M6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubl3Q9Z2M6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubl3Q9Z2M6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubl3Q9Z2M6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubl3Q9Z2M6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubl3Q9Z2M6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubl3Q9Z2M6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubl3Q9Z2M6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubl3Q9Z2M6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubl3Q9Z2M6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubl3Q9Z2M6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubl3Q9Z2M6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubl3Q9Z2M6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubl3Q9Z2M6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubl3Q9Z2M6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubl3Q9Z2M6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubl3Q9Z2M6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubl3Q9Z2M6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubl3Q9Z2M6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubl3Q9Z2M6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubl3Q9Z2M6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubl3Q9Z2M6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubl3Q9Z2M6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubl3Q9Z2M6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubl3Q9Z2M6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubl3Q9Z2M6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubl3Q9Z2M6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubl3Q9Z2M6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubl3Q9Z2M6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubl3Q9Z2M6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubl3Q9Z2M6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubl3Q9Z2M6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubl3Q9Z2M6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms