Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mbd2Q9Z2E1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mbd2Q9Z2E1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mbd2Q9Z2E1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mbd2Q9Z2E1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mbd2Q9Z2E1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mbd2Q9Z2E1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mbd2Q9Z2E1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mbd2Q9Z2E1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mbd2Q9Z2E1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mbd2Q9Z2E1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mbd2Q9Z2E1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mbd2Q9Z2E1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mbd2Q9Z2E1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mbd2Q9Z2E1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mbd2Q9Z2E1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mbd2Q9Z2E1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mbd2Q9Z2E1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mbd2Q9Z2E1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mbd2Q9Z2E1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mbd2Q9Z2E1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mbd2Q9Z2E1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mbd2Q9Z2E1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mbd2Q9Z2E1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mbd2Q9Z2E1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Mbd2Q9Z2E1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mbd2Q9Z2E1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mbd2Q9Z2E1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mbd2Q9Z2E1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mbd2Q9Z2E1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mbd2Q9Z2E1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd2Q9Z2E1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd2Q9Z2E1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd2Q9Z2E1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd2Q9Z2E1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd2Q9Z2E1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd2Q9Z2E1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd2Q9Z2E1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd2Q9Z2E1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd2Q9Z2E1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd2Q9Z2E1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd2Q9Z2E1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mbd2Q9Z2E1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mbd2Q9Z2E1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mbd2Q9Z2E1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mbd2Q9Z2E1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mbd2Q9Z2E1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mbd2Q9Z2E1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mbd2Q9Z2E1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms