Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z266

Snapin, SNARE-associated protein Snapin, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnapinQ9Z266 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SnapinQ9Z266 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SnapinQ9Z266 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SnapinQ9Z266 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SnapinQ9Z266 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SnapinQ9Z266 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SnapinQ9Z266 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SnapinQ9Z266 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SnapinQ9Z266 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SnapinQ9Z266 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SnapinQ9Z266 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SnapinQ9Z266 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SnapinQ9Z266 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SnapinQ9Z266 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SnapinQ9Z266 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SnapinQ9Z266 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SnapinQ9Z266 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SnapinQ9Z266 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SnapinQ9Z266 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SnapinQ9Z266 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SnapinQ9Z266 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SnapinQ9Z266 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SnapinQ9Z266 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SnapinQ9Z266 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SnapinQ9Z266 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SnapinQ9Z266 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SnapinQ9Z266 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SnapinQ9Z266 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SnapinQ9Z266 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SnapinQ9Z266 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SnapinQ9Z266 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SnapinQ9Z266 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SnapinQ9Z266 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SnapinQ9Z266 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnapinQ9Z266 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnapinQ9Z266 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnapinQ9Z266 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnapinQ9Z266 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnapinQ9Z266 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnapinQ9Z266 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms