Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna2d3Q9Z1L5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna2d3Q9Z1L5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna2d3Q9Z1L5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna2d3Q9Z1L5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cacna2d3Q9Z1L5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna2d3Q9Z1L5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna2d3Q9Z1L5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms