Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF8

Tusc2, Tumor suppressor candidate 2, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc2Q9WVF8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tusc2Q9WVF8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tusc2Q9WVF8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tusc2Q9WVF8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tusc2Q9WVF8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tusc2Q9WVF8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tusc2Q9WVF8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tusc2Q9WVF8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tusc2Q9WVF8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tusc2Q9WVF8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tusc2Q9WVF8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tusc2Q9WVF8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tusc2Q9WVF8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tusc2Q9WVF8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tusc2Q9WVF8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tusc2Q9WVF8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tusc2Q9WVF8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tusc2Q9WVF8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tusc2Q9WVF8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tusc2Q9WVF8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tusc2Q9WVF8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tusc2Q9WVF8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tusc2Q9WVF8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tusc2Q9WVF8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tusc2Q9WVF8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tusc2Q9WVF8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tusc2Q9WVF8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tusc2Q9WVF8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tusc2Q9WVF8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tusc2Q9WVF8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tusc2Q9WVF8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tusc2Q9WVF8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tusc2Q9WVF8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tusc2Q9WVF8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tusc2Q9WVF8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tusc2Q9WVF8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tusc2Q9WVF8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tusc2Q9WVF8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tusc2Q9WVF8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tusc2Q9WVF8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tusc2Q9WVF8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tusc2Q9WVF8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tusc2Q9WVF8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tusc2Q9WVF8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tusc2Q9WVF8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tusc2Q9WVF8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tusc2Q9WVF8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tusc2Q9WVF8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tusc2Q9WVF8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tusc2Q9WVF8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tusc2Q9WVF8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tusc2Q9WVF8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tusc2Q9WVF8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tusc2Q9WVF8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tusc2Q9WVF8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tusc2Q9WVF8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tusc2Q9WVF8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tusc2Q9WVF8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tusc2Q9WVF8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tusc2Q9WVF8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tusc2Q9WVF8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tusc2Q9WVF8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tusc2Q9WVF8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tusc2Q9WVF8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tusc2Q9WVF8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tusc2Q9WVF8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tusc2Q9WVF8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tusc2Q9WVF8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tusc2Q9WVF8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tusc2Q9WVF8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tusc2Q9WVF8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms