Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Stxbp4Q9WV89 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Stxbp4Q9WV89 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Stxbp4Q9WV89 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Stxbp4Q9WV89 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Stxbp4Q9WV89 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Stxbp4Q9WV89 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Stxbp4Q9WV89 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Stxbp4Q9WV89 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Stxbp4Q9WV89 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Stxbp4Q9WV89 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Stxbp4Q9WV89 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Stxbp4Q9WV89 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Stxbp4Q9WV89 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Stxbp4Q9WV89 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Stxbp4Q9WV89 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Stxbp4Q9WV89 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Stxbp4Q9WV89 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Stxbp4Q9WV89 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Stxbp4Q9WV89 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stxbp4Q9WV89 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stxbp4Q9WV89 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stxbp4Q9WV89 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stxbp4Q9WV89 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stxbp4Q9WV89 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Stxbp4Q9WV89 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Stxbp4Q9WV89 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Stxbp4Q9WV89 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stxbp4Q9WV89 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stxbp4Q9WV89 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stxbp4Q9WV89 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stxbp4Q9WV89 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stxbp4Q9WV89 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stxbp4Q9WV89 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stxbp4Q9WV89 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stxbp4Q9WV89 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stxbp4Q9WV89 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stxbp4Q9WV89 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stxbp4Q9WV89 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stxbp4Q9WV89 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stxbp4Q9WV89 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Stxbp4Q9WV89 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Stxbp4Q9WV89 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Stxbp4Q9WV89 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Stxbp4Q9WV89 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stxbp4Q9WV89 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stxbp4Q9WV89 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stxbp4Q9WV89 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stxbp4Q9WV89 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stxbp4Q9WV89 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stxbp4Q9WV89 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stxbp4Q9WV89 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stxbp4Q9WV89 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stxbp4Q9WV89 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stxbp4Q9WV89 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stxbp4Q9WV89 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stxbp4Q9WV89 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stxbp4Q9WV89 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stxbp4Q9WV89 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stxbp4Q9WV89 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Stxbp4Q9WV89 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stxbp4Q9WV89 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stxbp4Q9WV89 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stxbp4Q9WV89 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stxbp4Q9WV89 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stxbp4Q9WV89 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stxbp4Q9WV89 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stxbp4Q9WV89 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stxbp4Q9WV89 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stxbp4Q9WV89 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stxbp4Q9WV89 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stxbp4Q9WV89 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Stxbp4Q9WV89 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stxbp4Q9WV89 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stxbp4Q9WV89 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stxbp4Q9WV89 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Stxbp4Q9WV89 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Stxbp4Q9WV89 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Stxbp4Q9WV89 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Stxbp4Q9WV89 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stxbp4Q9WV89 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stxbp4Q9WV89 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stxbp4Q9WV89 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stxbp4Q9WV89 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stxbp4Q9WV89 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stxbp4Q9WV89 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Stxbp4Q9WV89 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Stxbp4Q9WV89 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Stxbp4Q9WV89 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Stxbp4Q9WV89 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Stxbp4Q9WV89 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Stxbp4Q9WV89 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Stxbp4Q9WV89 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Stxbp4Q9WV89 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Stxbp4Q9WV89 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Stxbp4Q9WV89 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Stxbp4Q9WV89 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stxbp4Q9WV89 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stxbp4Q9WV89 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stxbp4Q9WV89 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms