Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTY1

Pdcd7, Programmed cell death protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd7Q9WTY1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdcd7Q9WTY1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdcd7Q9WTY1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcd7Q9WTY1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdcd7Q9WTY1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcd7Q9WTY1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcd7Q9WTY1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcd7Q9WTY1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcd7Q9WTY1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcd7Q9WTY1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcd7Q9WTY1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcd7Q9WTY1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcd7Q9WTY1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcd7Q9WTY1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcd7Q9WTY1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcd7Q9WTY1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcd7Q9WTY1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms