Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hacd1Q9QY80 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms