Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hacd1Q9QY80 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hacd1Q9QY80 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hacd1Q9QY80 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hacd1Q9QY80 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hacd1Q9QY80 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms