Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQJ0

Tpcn1, Two pore calcium channel protein 1, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpcn1Q9EQJ0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpcn1Q9EQJ0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpcn1Q9EQJ0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpcn1Q9EQJ0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpcn1Q9EQJ0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpcn1Q9EQJ0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpcn1Q9EQJ0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpcn1Q9EQJ0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpcn1Q9EQJ0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpcn1Q9EQJ0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpcn1Q9EQJ0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpcn1Q9EQJ0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tpcn1Q9EQJ0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tpcn1Q9EQJ0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tpcn1Q9EQJ0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tpcn1Q9EQJ0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tpcn1Q9EQJ0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tpcn1Q9EQJ0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tpcn1Q9EQJ0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tpcn1Q9EQJ0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tpcn1Q9EQJ0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tpcn1Q9EQJ0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpcn1Q9EQJ0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpcn1Q9EQJ0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpcn1Q9EQJ0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tpcn1Q9EQJ0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tpcn1Q9EQJ0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tpcn1Q9EQJ0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpcn1Q9EQJ0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpcn1Q9EQJ0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpcn1Q9EQJ0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpcn1Q9EQJ0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpcn1Q9EQJ0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpcn1Q9EQJ0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpcn1Q9EQJ0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpcn1Q9EQJ0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpcn1Q9EQJ0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpcn1Q9EQJ0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpcn1Q9EQJ0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpcn1Q9EQJ0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpcn1Q9EQJ0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpcn1Q9EQJ0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpcn1Q9EQJ0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpcn1Q9EQJ0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpcn1Q9EQJ0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpcn1Q9EQJ0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpcn1Q9EQJ0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpcn1Q9EQJ0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpcn1Q9EQJ0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpcn1Q9EQJ0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tpcn1Q9EQJ0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tpcn1Q9EQJ0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tpcn1Q9EQJ0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tpcn1Q9EQJ0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tpcn1Q9EQJ0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tpcn1Q9EQJ0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tpcn1Q9EQJ0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpcn1Q9EQJ0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpcn1Q9EQJ0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpcn1Q9EQJ0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpcn1Q9EQJ0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpcn1Q9EQJ0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tpcn1Q9EQJ0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpcn1Q9EQJ0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpcn1Q9EQJ0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpcn1Q9EQJ0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpcn1Q9EQJ0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpcn1Q9EQJ0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpcn1Q9EQJ0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpcn1Q9EQJ0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpcn1Q9EQJ0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpcn1Q9EQJ0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpcn1Q9EQJ0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpcn1Q9EQJ0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tpcn1Q9EQJ0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tpcn1Q9EQJ0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tpcn1Q9EQJ0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tpcn1Q9EQJ0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tpcn1Q9EQJ0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpcn1Q9EQJ0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpcn1Q9EQJ0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpcn1Q9EQJ0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpcn1Q9EQJ0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpcn1Q9EQJ0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpcn1Q9EQJ0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpcn1Q9EQJ0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpcn1Q9EQJ0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpcn1Q9EQJ0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpcn1Q9EQJ0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpcn1Q9EQJ0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpcn1Q9EQJ0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpcn1Q9EQJ0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpcn1Q9EQJ0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpcn1Q9EQJ0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpcn1Q9EQJ0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpcn1Q9EQJ0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpcn1Q9EQJ0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpcn1Q9EQJ0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpcn1Q9EQJ0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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