Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Z6

Clca1, Calcium-activated chloride channel regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca1Q9D7Z6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clca1Q9D7Z6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clca1Q9D7Z6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clca1Q9D7Z6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clca1Q9D7Z6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clca1Q9D7Z6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clca1Q9D7Z6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clca1Q9D7Z6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clca1Q9D7Z6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clca1Q9D7Z6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Clca1Q9D7Z6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clca1Q9D7Z6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clca1Q9D7Z6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clca1Q9D7Z6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clca1Q9D7Z6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clca1Q9D7Z6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clca1Q9D7Z6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clca1Q9D7Z6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clca1Q9D7Z6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clca1Q9D7Z6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Clca1Q9D7Z6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clca1Q9D7Z6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clca1Q9D7Z6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clca1Q9D7Z6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clca1Q9D7Z6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clca1Q9D7Z6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clca1Q9D7Z6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clca1Q9D7Z6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clca1Q9D7Z6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clca1Q9D7Z6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clca1Q9D7Z6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clca1Q9D7Z6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clca1Q9D7Z6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clca1Q9D7Z6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clca1Q9D7Z6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clca1Q9D7Z6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clca1Q9D7Z6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clca1Q9D7Z6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clca1Q9D7Z6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clca1Q9D7Z6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clca1Q9D7Z6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clca1Q9D7Z6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Clca1Q9D7Z6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clca1Q9D7Z6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clca1Q9D7Z6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clca1Q9D7Z6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clca1Q9D7Z6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clca1Q9D7Z6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clca1Q9D7Z6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clca1Q9D7Z6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clca1Q9D7Z6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clca1Q9D7Z6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clca1Q9D7Z6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clca1Q9D7Z6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clca1Q9D7Z6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clca1Q9D7Z6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clca1Q9D7Z6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clca1Q9D7Z6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clca1Q9D7Z6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clca1Q9D7Z6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clca1Q9D7Z6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clca1Q9D7Z6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clca1Q9D7Z6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clca1Q9D7Z6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clca1Q9D7Z6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clca1Q9D7Z6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clca1Q9D7Z6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clca1Q9D7Z6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clca1Q9D7Z6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clca1Q9D7Z6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clca1Q9D7Z6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clca1Q9D7Z6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clca1Q9D7Z6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clca1Q9D7Z6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clca1Q9D7Z6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clca1Q9D7Z6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clca1Q9D7Z6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clca1Q9D7Z6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clca1Q9D7Z6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clca1Q9D7Z6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clca1Q9D7Z6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clca1Q9D7Z6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clca1Q9D7Z6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clca1Q9D7Z6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clca1Q9D7Z6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clca1Q9D7Z6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clca1Q9D7Z6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clca1Q9D7Z6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clca1Q9D7Z6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca1Q9D7Z6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca1Q9D7Z6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca1Q9D7Z6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca1Q9D7Z6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca1Q9D7Z6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca1Q9D7Z6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca1Q9D7Z6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca1Q9D7Z6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca1Q9D7Z6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clca1Q9D7Z6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca1Q9D7Z6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms