Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc94Q9D6J3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc94Q9D6J3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc94Q9D6J3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc94Q9D6J3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc94Q9D6J3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc94Q9D6J3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc94Q9D6J3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc94Q9D6J3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc94Q9D6J3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc94Q9D6J3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc94Q9D6J3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc94Q9D6J3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc94Q9D6J3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc94Q9D6J3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc94Q9D6J3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc94Q9D6J3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc94Q9D6J3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc94Q9D6J3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc94Q9D6J3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc94Q9D6J3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc94Q9D6J3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc94Q9D6J3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc94Q9D6J3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc94Q9D6J3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc94Q9D6J3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc94Q9D6J3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc94Q9D6J3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc94Q9D6J3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc94Q9D6J3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc94Q9D6J3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc94Q9D6J3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc94Q9D6J3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc94Q9D6J3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc94Q9D6J3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc94Q9D6J3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc94Q9D6J3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc94Q9D6J3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc94Q9D6J3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc94Q9D6J3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc94Q9D6J3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc94Q9D6J3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc94Q9D6J3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc94Q9D6J3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc94Q9D6J3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc94Q9D6J3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc94Q9D6J3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc94Q9D6J3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc94Q9D6J3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc94Q9D6J3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc94Q9D6J3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc94Q9D6J3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc94Q9D6J3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc94Q9D6J3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc94Q9D6J3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc94Q9D6J3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc94Q9D6J3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc94Q9D6J3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc94Q9D6J3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc94Q9D6J3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc94Q9D6J3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc94Q9D6J3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc94Q9D6J3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc94Q9D6J3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc94Q9D6J3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc94Q9D6J3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc94Q9D6J3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc94Q9D6J3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc94Q9D6J3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc94Q9D6J3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc94Q9D6J3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc94Q9D6J3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc94Q9D6J3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc94Q9D6J3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc94Q9D6J3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc94Q9D6J3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc94Q9D6J3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc94Q9D6J3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc94Q9D6J3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc94Q9D6J3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc94Q9D6J3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc94Q9D6J3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc94Q9D6J3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc94Q9D6J3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc94Q9D6J3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc94Q9D6J3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc94Q9D6J3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc94Q9D6J3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc94Q9D6J3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc94Q9D6J3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc94Q9D6J3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc94Q9D6J3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc94Q9D6J3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc94Q9D6J3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc94Q9D6J3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc94Q9D6J3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc94Q9D6J3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc94Q9D6J3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc94Q9D6J3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms