Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ribc2Q9D4Q1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ribc2Q9D4Q1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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