Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXF7

Chd1l, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1lQ9CXF7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Chd1lQ9CXF7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Chd1lQ9CXF7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,35■■□□□ 1,81
Chd1lQ9CXF7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Chd1lQ9CXF7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Chd1lQ9CXF7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Chd1lQ9CXF7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Chd1lQ9CXF7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Chd1lQ9CXF7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,34■■□□□ 1,81
Chd1lQ9CXF7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Chd1lQ9CXF7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,8
Chd1lQ9CXF7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Chd1lQ9CXF7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Chd1lQ9CXF7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Chd1lQ9CXF7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Chd1lQ9CXF7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Chd1lQ9CXF7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Chd1lQ9CXF7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Chd1lQ9CXF7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Chd1lQ9CXF7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Chd1lQ9CXF7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Chd1lQ9CXF7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Chd1lQ9CXF7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Chd1lQ9CXF7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Chd1lQ9CXF7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Chd1lQ9CXF7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Chd1lQ9CXF7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Chd1lQ9CXF7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Chd1lQ9CXF7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26,28■■□□□ 1,8
Chd1lQ9CXF7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Chd1lQ9CXF7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Chd1lQ9CXF7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Chd1lQ9CXF7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Chd1lQ9CXF7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Chd1lQ9CXF7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,27■■□□□ 1,8
Chd1lQ9CXF7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Chd1lQ9CXF7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Chd1lQ9CXF7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Chd1lQ9CXF7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Chd1lQ9CXF7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Chd1lQ9CXF7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Chd1lQ9CXF7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Chd1lQ9CXF7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Chd1lQ9CXF7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Chd1lQ9CXF7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Chd1lQ9CXF7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Chd1lQ9CXF7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Chd1lQ9CXF7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Chd1lQ9CXF7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Chd1lQ9CXF7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Chd1lQ9CXF7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26,21■■□□□ 1,79
Chd1lQ9CXF7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Chd1lQ9CXF7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Chd1lQ9CXF7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,2■■□□□ 1,79
Chd1lQ9CXF7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Chd1lQ9CXF7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Chd1lQ9CXF7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Chd1lQ9CXF7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Chd1lQ9CXF7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Chd1lQ9CXF7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26,18■■□□□ 1,78
Chd1lQ9CXF7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Chd1lQ9CXF7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Chd1lQ9CXF7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Chd1lQ9CXF7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Chd1lQ9CXF7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Chd1lQ9CXF7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26,17■■□□□ 1,78
Chd1lQ9CXF7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Chd1lQ9CXF7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Chd1lQ9CXF7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Chd1lQ9CXF7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Chd1lQ9CXF7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Chd1lQ9CXF7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Chd1lQ9CXF7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Chd1lQ9CXF7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Chd1lQ9CXF7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Chd1lQ9CXF7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Chd1lQ9CXF7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Chd1lQ9CXF7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Chd1lQ9CXF7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Chd1lQ9CXF7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26,13■■□□□ 1,77
Chd1lQ9CXF7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26,13■■□□□ 1,77
Chd1lQ9CXF7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Chd1lQ9CXF7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Chd1lQ9CXF7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Chd1lQ9CXF7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Chd1lQ9CXF7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Chd1lQ9CXF7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Chd1lQ9CXF7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Chd1lQ9CXF7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Chd1lQ9CXF7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Chd1lQ9CXF7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Chd1lQ9CXF7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Chd1lQ9CXF7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Chd1lQ9CXF7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Chd1lQ9CXF7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Chd1lQ9CXF7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Chd1lQ9CXF7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Chd1lQ9CXF7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Chd1lQ9CXF7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Chd1lQ9CXF7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38,8 ms