Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf16Q9BUW7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf16Q9BUW7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf16Q9BUW7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf16Q9BUW7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf16Q9BUW7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C9orf16Q9BUW7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C9orf16Q9BUW7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf16Q9BUW7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf16Q9BUW7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf16Q9BUW7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf16Q9BUW7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf16Q9BUW7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf16Q9BUW7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf16Q9BUW7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf16Q9BUW7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf16Q9BUW7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf16Q9BUW7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf16Q9BUW7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf16Q9BUW7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf16Q9BUW7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf16Q9BUW7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9orf16Q9BUW7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9orf16Q9BUW7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9orf16Q9BUW7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf16Q9BUW7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf16Q9BUW7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf16Q9BUW7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf16Q9BUW7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf16Q9BUW7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf16Q9BUW7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf16Q9BUW7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf16Q9BUW7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf16Q9BUW7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf16Q9BUW7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf16Q9BUW7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf16Q9BUW7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf16Q9BUW7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf16Q9BUW7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf16Q9BUW7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf16Q9BUW7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9orf16Q9BUW7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9orf16Q9BUW7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9orf16Q9BUW7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9orf16Q9BUW7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9orf16Q9BUW7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf16Q9BUW7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf16Q9BUW7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf16Q9BUW7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf16Q9BUW7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf16Q9BUW7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf16Q9BUW7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf16Q9BUW7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf16Q9BUW7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf16Q9BUW7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf16Q9BUW7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf16Q9BUW7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf16Q9BUW7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf16Q9BUW7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf16Q9BUW7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf16Q9BUW7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf16Q9BUW7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf16Q9BUW7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf16Q9BUW7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf16Q9BUW7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf16Q9BUW7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf16Q9BUW7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf16Q9BUW7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf16Q9BUW7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf16Q9BUW7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf16Q9BUW7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms