Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rdh10Q8VCH7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rdh10Q8VCH7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rdh10Q8VCH7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Rdh10Q8VCH7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Rdh10Q8VCH7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rdh10Q8VCH7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rdh10Q8VCH7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rdh10Q8VCH7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rdh10Q8VCH7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Rdh10Q8VCH7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rdh10Q8VCH7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdh10Q8VCH7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rdh10Q8VCH7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rdh10Q8VCH7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rdh10Q8VCH7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rdh10Q8VCH7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rdh10Q8VCH7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rdh10Q8VCH7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rdh10Q8VCH7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rdh10Q8VCH7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rdh10Q8VCH7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rdh10Q8VCH7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rdh10Q8VCH7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rdh10Q8VCH7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rdh10Q8VCH7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rdh10Q8VCH7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rdh10Q8VCH7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rdh10Q8VCH7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rdh10Q8VCH7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rdh10Q8VCH7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rdh10Q8VCH7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rdh10Q8VCH7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rdh10Q8VCH7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rdh10Q8VCH7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rdh10Q8VCH7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rdh10Q8VCH7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rdh10Q8VCH7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rdh10Q8VCH7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rdh10Q8VCH7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rdh10Q8VCH7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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