Protein–RNA interactions for Protein: Q8R207

Sptssa, Serine palmitoyltransferase small subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssaQ8R207 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
SptssaQ8R207 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,31■□□□□ 0,84
SptssaQ8R207 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
SptssaQ8R207 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
SptssaQ8R207 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,29■□□□□ 0,84
SptssaQ8R207 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
SptssaQ8R207 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
SptssaQ8R207 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
SptssaQ8R207 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20,29■□□□□ 0,84
SptssaQ8R207 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
SptssaQ8R207 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20,28■□□□□ 0,84
SptssaQ8R207 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20,28■□□□□ 0,84
SptssaQ8R207 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,27■□□□□ 0,84
SptssaQ8R207 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20,27■□□□□ 0,84
SptssaQ8R207 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
SptssaQ8R207 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
SptssaQ8R207 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
SptssaQ8R207 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
SptssaQ8R207 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20,25■□□□□ 0,83
SptssaQ8R207 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
SptssaQ8R207 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
SptssaQ8R207 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
SptssaQ8R207 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20,24■□□□□ 0,83
SptssaQ8R207 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
SptssaQ8R207 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
SptssaQ8R207 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
SptssaQ8R207 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,23■□□□□ 0,83
SptssaQ8R207 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
SptssaQ8R207 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
SptssaQ8R207 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20,22■□□□□ 0,83
SptssaQ8R207 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
SptssaQ8R207 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
SptssaQ8R207 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
SptssaQ8R207 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
SptssaQ8R207 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
SptssaQ8R207 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20,21■□□□□ 0,83
SptssaQ8R207 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
SptssaQ8R207 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
SptssaQ8R207 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
SptssaQ8R207 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
SptssaQ8R207 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
SptssaQ8R207 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
SptssaQ8R207 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,19■□□□□ 0,82
SptssaQ8R207 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
SptssaQ8R207 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
SptssaQ8R207 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
SptssaQ8R207 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20,19■□□□□ 0,82
SptssaQ8R207 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
SptssaQ8R207 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
SptssaQ8R207 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20,18■□□□□ 0,82
SptssaQ8R207 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
SptssaQ8R207 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,17■□□□□ 0,82
SptssaQ8R207 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
SptssaQ8R207 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
SptssaQ8R207 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20,17■□□□□ 0,82
SptssaQ8R207 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
SptssaQ8R207 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,16■□□□□ 0,82
SptssaQ8R207 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
SptssaQ8R207 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20,16■□□□□ 0,82
SptssaQ8R207 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
SptssaQ8R207 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
SptssaQ8R207 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
SptssaQ8R207 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
SptssaQ8R207 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
SptssaQ8R207 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
SptssaQ8R207 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
SptssaQ8R207 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
SptssaQ8R207 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
SptssaQ8R207 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
SptssaQ8R207 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20,12■□□□□ 0,81
SptssaQ8R207 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,12■□□□□ 0,81
SptssaQ8R207 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
SptssaQ8R207 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
SptssaQ8R207 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
SptssaQ8R207 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
SptssaQ8R207 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
SptssaQ8R207 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
SptssaQ8R207 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
SptssaQ8R207 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20,11■□□□□ 0,81
SptssaQ8R207 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
SptssaQ8R207 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
SptssaQ8R207 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
SptssaQ8R207 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
SptssaQ8R207 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
SptssaQ8R207 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20,09■□□□□ 0,81
SptssaQ8R207 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
SptssaQ8R207 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
SptssaQ8R207 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
SptssaQ8R207 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
SptssaQ8R207 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,81
SptssaQ8R207 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
SptssaQ8R207 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20,07■□□□□ 0,8
SptssaQ8R207 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20,07■□□□□ 0,8
SptssaQ8R207 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20,07■□□□□ 0,8
SptssaQ8R207 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
SptssaQ8R207 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
SptssaQ8R207 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
SptssaQ8R207 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20,06■□□□□ 0,8
SptssaQ8R207 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,05■□□□□ 0,8
SptssaQ8R207 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,05■□□□□ 0,8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,6 ms